У стоматології хлоргексидин призначають при стоматитах, гінгівітах, запаленнях у порожнині рота – щоб придушити діяльність патогенної мікрофлори та запобігти подальшому розвитку інфекції..
Для цього потрібно набрати невелику кількість 0,05відсотків розчину хлоргексидину в рот і полоскати не менше хвилини. Це важлива умова, адже тільки при тривалому полосканні хлоргексидин біглюконат утворює на поверхні слизової тонку плівку, яка боротиметься з бактеріями ще протягом кількох годин
«Заливатись» хлоргексидином або полоскати рот перекисом водню точно не можна. Досить непогано працює Мірамістін, цей антисептик розроблений якраз для слизових, тому діє обережно.
Не можна безконтрольно використовувати розчин хлоргексидину для полоскання ясен та зубівЦе може призвести до низки проблем