Препаратами вибору для лікування гострого пієлонефриту є неантисинегнійні цефалоспорини III покоління в режимі монотерапії: цефотаксим 1 г внутрішньом'язово 3 рази на добу, цефтріаксон 1,0 внутрішньом'язово 2 рази на добу, цефіксім 200 мг внутрішньо 2 рази на добу, цефтибутен 400 мг внутрішньо 1 раз на добу.
Як правило, терапію цефтріаксон слід продовжувати не менше 2 днів після зникнення ознак і симптомів інфекції. Звичайна тривалість терапії становить від 4 до 14 днів; при ускладнених інфекціях може знадобитися триваліша терапія
Цефтріаксон використовується для лікування інфекцій: Черевної порожнини та черевної стінки (перитоніт). Сечовивідних шляхів та нирок.
Використовують антибіотики широкого спектра дії, що не мають нефротоксичності: ампіциліни (Аугментин), цефалоспорини (Цефалексин), фторхінолони (Офлоксацин, Абактал, Ноліцин, Ципробай). Необхідна протимікробна терапія. Для цього призначаються нітрофурани (Фурамаг, Фурагін).