Фурагін виводиться нирками, переважно шляхом канальцевої секреції (85відсотків). 8-13відсотків фурагину потрапляють у сечу у незміненому вигляді, де його концентрація в середньому багато разів перевищує мінімальну концентрацію для більшості чутливих бактерій. Максимальна концентрація фурагіну в сечі – 5,7 мкг/мл.
Побічна дія З боку травної системи: діарея, диспептичні явища, біль у животі, запор, блювання. З боку ЦНС та периферичної нервової системи: запаморочення, сонливість, порушення зору; рідко – поліневропатія. Алергічні реакції: висипання, свербіж
Після одноразової дози 200 мг Cmax фурагіну досягається в плазмі крові через 30 хв, зберігається на цьому рівні протягом 1 години, потім повільно знижується. Бактеріостатична концентрація фурагіну в плазмі крові зберігається протягом 8-12 год
При застосуванні препарату можливий розвиток діареї, викликаної Clostridium difficile (псевдомембранозний коліт). У легких випадках достатньо відміни препарату, у тяжких випадках необхідно призначити відповідне лікування. Не можна застосовувати лікарські препарати, які гальмують перистальтику кишечника.