Антисептичний засіб. Має слабкі бактеріостатичні та фунгістатичні властивості, має протипедикульозну дію. У комбінації з оксихіноліну сульфатом має контрацептивні властивості. Антисептичний засіб для застосування в ЛОР-практиці, дерматології, офтальмології..
Водний розчин використовується в офтальмології та дерматології. Борна кислота застосовується як слабке, не дратівливе тканини антисептичний, дезінфікуючий і протигрибковий засіб. Борну кислоту застосовують зовнішньо у вигляді водних та спиртових розчинів, мазей, а також призначають у вигляді присипок при захворюваннях шкіри
При гострому отруєнні людей вона вражає мозок, слизові оболонки та шкіру, а при хронічному – кровотворні та статеві клітини.. Особливо небезпечна борна кислота для ембріонів, що розвиваються. Навіть надходження одноразової нетоксичної дози в організм матері може спричинити патологічні зміни плода.