Атоваквон (Mepron) – антибіотик, який використовується, щоб вбити цисти токсоплазми у хворих на ВІЛ; Кліндаміцин (Dalacin та інші) – напівсинтетичний антибіотик групи лінкозамідів, який у поєднанні з Атоваквоном здається оптимальним при знищенні цист токсоплазми у мишей.
Цілком позбутися цист токсоплазми майже неможливотому лікування спрямоване на зміцнення імунітету. Пацієнти, у яких яскраво виражені симптоми, потребують тривалого лікування, застосування хіміотерапевтичних препаратів та антибіотиків.
Токсоплазма гине при нагріванні м'яса до 67 °C або охолодженні до -13 °C.
Призначаються препарати «Фансидар», «Роваміцин» та «Бісептол». Фансидар містить сульфадоксин 500 мг та піриметамін 25 мг.