У хребетних з ентодерми розвивається слизова оболонка всього кишечника та пов'язані з ним залози (печінка, підшлункова залоза та ін). У риб, крім того – плавальний міхур і внутрішні зябра, а у вищих хребетних – легені.
з ектодерми розвиваються зовнішні покриви та нервова система (головний та спинний мозок); з ентодерми – травна та дихальна (повітряні шляхи та легкі) системи; з мезодерми – скелет, м'язи, кров та деякі внутрішні органи.
Ектодерма формує нервову систему (у хребетних: спинний мозок, периферичні нерви та головний мозок), зубну емаль та епідерміс (шкірний епітелій). Також він утворює органи чуття, епітелій переднього та заднього відділів травної системи.
З ентодерми формуються:
- травна система;
- дихальна система;
- видільна система;
- залози внутрішньої секреції.