Основна різниця досліджень КТ і МРТ полягає в тому, що метод МР-томографії дозволяє набагато краще візуалізувати збагачені водою та водними розчинами м'які тканини, кровоносні судини, лімфоструми та нервові тканини, хрящеподібні утворення. А кісткові структури видно на МРТ гірше, ніж на КТ.3 серп. 2023 р.
В цілому, МРТ краще розрізняє м'які тканини. Кістки при цьому не можуть бути видні – резонанс від кальцію відсутня і кісткова тканина на МР-томограм видно лише опосередковано
МРТ орбіт дозволяє уточнити патологічні зміни структур орбіти (очниці) – очного яблука, очних м'язів, зорового нерва, ретробульбарної клітковини тощо. д. При дослідженні можна побачити в різних проекціях або об'ємному моделюванні весь вміст, що знаходиться у очниці.
КТ орбіт – дозволяє чітко аналізувати всю структуру очної ямки: очне яблуко, окорухові м'язи, м'які тканини навколо орбіти, слізні залози, зоровий нерв.. Цей метод дослідження дозволяє добре діагностувати травми очної ямки, або очного яблука, так і такий стан, як екзофтальм.