Відмінність МРТ від КТ Комп'ютерна томографія (КТ) найкраще сприймає кісткові структури. Тому КТ добре використовуватиме визначення кісткових травм і різних ушкоджень. На МРТ добре видно м'які тканини: м'язи, судини, хрящі, спинний та головний мозок..
Можна констатувати, що на сьогодні МРТ більш інформативна при дифузному та осередковому ураженні структур головного мозку, патології спинного мозку та краніоспінального стику (тут КТ зовсім неінформативна), ураження хрящової тканини. КТ переважна при захворюваннях грудної клітки, живота, тазу
В разі КТ лікар не просто бачить тканини, але може вивчати їхню рентгенівську щільність, яка змінюється при захворюваннях; у разі МРТ лікар оцінює зображення лише візуально.
Без розмаїття КТ може виявити тільки метастази в легкі, лімфатичні вузли та кістки, але інформативність її буде все одно нижче, ніж при комп'ютерної томографії із внутрішньовенним введенням контрастної речовини.