Гострий пієлонефрит виникає раптово (протягом кількох годин чи днів). При правильному лікуванні хвороба триває від 10 до 20 днів (залежно від збудника хвороби) і, як правило, закінчується повним одужанням.
Якщо при гострому серозному пієлонефриті антибактеріальна терапія проводиться протягом 10-14 днівпри гнійному пієлонефриті тривалість проведення антибактеріальної терапії збільшується.
Терміни госпіталізації при пієлонефриті залежать від походження інфекції, її перебігу, реакції на лікування, наявності ускладнень та супутніх захворювань та становлять в середньому 2-3 тижні. Після виписки із стаціонару призначається амбулаторне лікування на 5-7 днів.
Лікування хронічного пієлонефриту консервативне, продовжується протягом декількох років. Анібактеріальні препарати застосовують курсами по 10 днів раз на місяць, у деяких випадках показано тривалу терапію антибіотиками зі зміною препарату кожні 5-7 днів.