Лікарський засіб застосовується у вигляді зрошень, полоскань та аплікацій – 5-10 мл розчину наносять на уражену поверхню шкіри або слизових оболонок з експозицією 1-3 хв 2-3 рази на добу (на тампоні або зрошенням).
Для полоскання рота та зубів розчин хлоргексидину розводити не потрібно, він вже продається у готовому вигляді для вживання – у концентрації 0,05відсотків або 0,1відсотків. Але якщо у вашій аптеці є тільки розчин високої концентрації, його можна використовувати для полоскання, розвівши кип'яченою водою: 20відсотків розчин – 2 мл на 1 л води
Розчин хлоргексидину хороший тим, що не має кольору та запаху. Але важливою особливістю цього препарату є те, що він діє лише у момент нанесення на рану. Це означає що розчином потрібно змочити бинт і прикладати до рани на кілька хвилин кілька разів на день.
Гнійні рани, інфіковані опіки, бактеріальні та грибкові захворювання шкіри та слизових оболонок, у т. ч. у стоматології (полоскання та зрошення – гінгівіт, стоматит, афти, пародонтит, альвеоліт), хірургії, урології, акушерстві-гінекології.