Отриманий 0,25відсотків розчин закопують піпеткою у зовнішній слуховий прохід по 5 крапель розчину 3 рази на день. Тривалість курсу лікування при гострому гнійному середньому отиті та загостренні хронічного гнійного середнього отиту 10 днів (при досягненні клінічного покращення курс лікування може становити 6–8 днів).
Важливо виготовляти розчин у стерильному посуді та використовувати відразу після приготування. Отримані ліки закопують за допомогою піпетки у вухо по 5 крапель 3 рази на добу протягом 10 днів. Після рекомендується лежати в тому ж положенні кілька хвилин, а також прикрити вухо ваткою
Для лікування отиту, згідно з інструкцією, «Діоксидин» у вуха капають вже на пізній стадії хвороби.. Причому лікування негнійних та легких форм отиту не потребує застосування цих ліків. Якщо діагностовано гнійне запалення вуха, лікарський засіб застосовують, закопуючи одночасно у вухо та носові пазухи
Розчин діоксидину вводять у порожнину через катетер, дренажну трубку або шприцом. Максимальна добова доза для введення порожнини 70 мл 1відсотків розчину. Препарат вводять у порожнину зазвичай 1 раз на добу. За показаннями можливе введення добової дози у два прийоми.