Лікарський засіб застосовується у вигляді зрошень, полоскань та аплікацій – 5-10 мл розчину наносять на уражену поверхню шкіри або слизових оболонок з експозицією 1-3 хв 2-3 рази на добу (на тампоні або шляхом зрошення).
Для полоскання рота та зубів розчин хлоргексидину розводити не потрібно, він уже продається у готовому вигляді для вживання – у концентрації 0,05відсотків або 0,1відсотків. Але якщо у вашій аптеці є тільки розчин високої концентрації, то його можна використовувати для полоскання, розвівши кип'яченою водою: 20відсотків розчин – 2 мл на 1 л води
Розчин хлоргексидину хороший тим, що не має кольору та запаху. Але важливою особливістю цього препарату є те, що він діє лише у момент нанесення на рану. Це означає що розчином потрібно змочити бинт і прикладати до рани на кілька хвилин кілька разів на день.
Якщо хлоргексидин потрапив на чутливу ділянку випадково, потрібно його негайно змити.